资源:
沃尔特和伊丽莎霍尔研究所
概要:
乳腺癌研究人员和生物信息学家的共同努力为乳房发育的分子变化提供了新的见解。
研究小组比较乳腺(乳腺组织)中单个细胞中表达的基因,以了解在发育过程中发生的广泛的分子变化。这揭示了青春期开始时基因表达的急剧变化,并使团队能够识别以前未被识别的乳房细胞类型细胞。
乳房如何发展?
乳腺组织由干细胞发育而来,分化并分化产生怀孕后产生和释放乳汁所需的细胞。
包括由Jane Visvader教授,Gordon Smyth教授和Geoff Lindeman教授领导的Bhupinder Pal博士,陈芸芸博士和FrançoisVaillant博士在内的一个研究所研究小组调查了随乳房发育而发生的分子变化。他们的研究发表在Nature Communications。
Visavder教授与Lindeman教授共同领导该研究所的乳腺癌研究项目,他表示,研究小组专注于乳房在青春期之前,期间和之后的变化。她说:“我们通过分析数以千计的细胞来比较哪些基因是由乳腺细胞表达的 - 它们的转录组 - 在全球范围内。“这使我们能够揭示青春期发育过程中发生的转录程序的巨大变化,这是细胞成为不同类型的成体细胞的时间。在此之前,在青春期之前的乳房,细胞都在一个相对相似和不成熟的状态“。
Visvader教授表示,这一发现对于了解乳腺癌如何发生具有重要意义。她说:“这种技术可以用来了解哪些细胞在妇女身上出现罹患乳腺癌的风险增加,而且这种技术为更深入地研究乳腺癌异质性提供了新的途径。”
放大到单个单元格。
该研究所生物信息学部负责人Gordon Smyth教授说,这项发现的关键是一种称为单细胞RNA测序的新技术,研究人员可以确定数百至数千个细胞的转录组。
他说:“我们能够运用我们在生物信息学方面的专业知识来区分乳房中不同种类的细胞。“这显示了有助于乳房发育的基因表达程序的惊人变化。”
该研究的一个重要方面是它使用了研究所提供的两种不同的转录组学技术。一个技术平台能够对数百个细胞进行深度测序,另一个技术平台能够对数千个细胞进行测序,尽管深度较小。
Smyth教授说:“这种使用两种测序平台的双重方法使我们能够全面调查研究问题,比我们单独使用任一平台更有效。”
协作的力量。
林德曼教授说,这项研究是生物学家,生物信息学家和技术专家之间多学科合作的成功案例。他说:“研究所多个部门的专业知识对我们团队的发现至关重要。
“生物学的未来在于合作,运用新技术解决复杂的问题,揭示我们身体如何运作的新的细节层次,这只是多学科研究的力量和潜力的一个例子。
该研究得到了国家卫生和医学研究委员会,澳大利亚癌症研究基金会,国家乳腺癌基金会和维多利亚州政府的支持。
(选自《麦肯息讯》)