慕尼黑工业大学(TUM)的研究人员在图书馆对330000多种基本代表所有人类蛋白质的参考合成肽进行综合报告。它是蛋白质组学工具项目的主要里程碑,该项目旨在将人类蛋白质组信息转化为新的分子以及用于发现药物潜能、个性化医学和生命科学研究的数字工具。
在发表在《自然方法》的手稿中,蛋白质组学工具科学家报告了330000多个代表所有典型的人类蛋白质组研究的参考肽的合成(被称为蛋白质组学工具参考肽库)。所有的肽都用多模态的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析,创造数以百万计的高质量的参考光谱纲要(称为proteometools谱简编前景)。研究表明使用这些试剂和数据从少量观察到用液相色谱串联质谱分析预测肽来识别蛋白质。
数据免费提供给全球科学界。
TUM、JPT多肽技术(IPT)、SAP以及Thermo Fisher 科技通过数据分析平台ProteomicsDB和数据库PRIDE使数据免费提供给科学界的科学家们,促进全球合作。
展望未来,该项目将额外产生一百万个肽并关注相应癌症突变的光谱变异,以及转录后的修饰,如磷酸化、乙酰化、泛素化。
科学家将使用新资源将研究转向人类蛋白质分子的大量信息,作为新的试剂、设备、工作流程,以提高蛋白质组学在科学和医学中的应用。
肿瘤蛋白质组学和生物分析的负责人以及项目协调员Bernhard Kuster教授说:“蛋白质组学工具开始努力把学术和产业合作伙伴结合起来,在蛋白质组学领域做出重要贡献。我们很高兴看到,这个工作现在有了大量重要成果。”
开发新技术、改进现有的硬件、软件和工作流程。
“串联质谱的合成肽代表的人类蛋白质合成缓解了一些蛋白质鉴定和定量的问题。肽库和光谱现在允许我们开发新技术并改进现有的硬件、软件、工作流程以及蛋白质组学试剂。令所有的数据为公众提供了一个极好的机会,利用该资源做出实验室能做的事情。我们现在向社会提出进行肽测量及确定,并在该计划财团不可用的平台上建立LC-MS/MS数据。”