癌症和糖尿病生物标记物的新测试办法更详细1000倍
用于检测癌症和糖尿病生物标志物的新测试办法,比现有的方法更详细超过1000倍和提升100%的速度,由英国华威大学化学系奥康纳研究小组领导进行的新研究表明,命名为2D质谱(2DMS),该测试办法提供了一个新工具,在快速发展的蛋白质结构和功能研究领域:蛋白质组学。研究人员认为,同样的方法可以应用到任何蛋白质基的样本中,同时正在用来测试癌细胞和II型糖尿病相关的蛋白质。
研究人员发现,大的胶原蛋白可以分割成更小的片段,并通过多维质谱法进行分析,得到的数据比以前质量光谱法的数据更详细1000倍,同时比使用现有技术对相同样品进行分析更快100%。谈到2DMS和其潜在作用,华威大学化学系教授和奥康纳小组领导彼得•奥康纳说:“在每一个癌细胞中都存在至少一百万的肽来组成蛋白质机器,使细胞发挥功能。理解所有的肽和蛋白质的结构和化学性能将能够开发突破性处理办法,使用2DMS提供了一种新的工具,来比以前更详细的研究他们。”
2DMS由核磁共振领域的工具激发,信号被铺在一个多层面的画布上,通过在样本中调制特定的信号,然后跟踪最终信号的调制频率。奥康纳教授解释说:“2DMS方法用一种方式调节离子信号强度,在其中延续到碎片离子信号,并因此使研究人员能够关联单独碎片离子信号与母离子- 有效地让样品中的每个分子同时进行测序。
“由于胶原有超过400个单独的肽信号和整个细胞有上万个,此方法节省了大量的时间,因为没有必要单独地分离和片断化每一个序列;他们将所有碎片并联在一起,然后数据可以被提取进行个别片段扫描。”2DMS的这种应用起源于英国华威大学化学系学生海莉•西蒙大学的本科论文项目。最初旨在找到所有已知的交联胶原,她在处理数据时遇到了困难,由于需要隔离每个> 400的前体肽离子和单独排序它们。西蒙女士于是决定尝试新的2DMS技术,成功地实现了分离的显著水平和非常详细的信息。
西蒙女士谈论该工作说:“当利用质谱法研究时,处理过的胶原样品中的许多种类表现类似。理清该数据,同时考虑到多种可能的解释,让我们面临一个显著挑战。通常,物种这样的分离是不可能的,如果不进行许多实验。“通过使用2DMS,我们能够收集我们在胶原样品中观察到的一切信息,仅仅进行一个实验。在处理后,结果作为一个单一光谱被表达出来,使类型可以很容易地识别。这有助于识别样本中的组件,这反过来又可以用于确定关于蛋白质的结构信息“。